Vroeger was het verschil tussen een fysiotherapeut en een oefentherapeut erg groot. In de fysiotherapie werd vroeger voornamelijk met de handen behandeld (hands on), zoals bijvoorbeeld door middel van massages of mobilisaties en in de oefentherapie werd er behandeld door middel van het geven van oefeningen dus hands off. Eigenlijk is dit het grootste verschil tussen beide therapieën. Tegenwoordig zijn deze verschillen minder groot, er is veel onderzoek gedaan naar de effectiviteit van hands on en hands off behandelingen en hieruit is gebleken dat niet alle hands on behandelingen even effectief waren. Mede hierdoor worden er tegenwoordig door fysiotherapeuten ook meer actieve behandelingen gegeven. Bij de fysiotherapeut is het niet ongebruikelijk om oefeningen te doen of mee naar huis te krijgen, echter kan deze behandeling nog wel in combinatie plaats vinden met de hands on behandelingen. Bij een oefentherapeut worden echt alleen behandelingen gegeven in de vorm van oefentherapie.

Naast het verschil in hands on en hands off therapie is er ook een verschil in visie. Een oefen therapeut probeert namelijk de oorzaak van je klachten aan te pakken door middel van het kijken naar dagelijkse bewegingspatronen. Oefentherapie is vanuit 2 verschillende zienswijzen ontstaan namelijk de caesar en de mensendieck methode, waarvan de mensendieck methode voornamelijk gericht is op aanspannen en caesar met name gericht is op ontspanning. Beide therapieën hebben zich verenigd in een beroepsgroep en de oefentherapie zal zich dan ook met name richten op oefeningen voor de dagelijkse houding die je zelfstandig thuis uit kunt voeren tijdens jouw dagelijkse bezigheden.